实验动物科学 ›› 2024, Vol. 41 ›› Issue (3): 26-32.DOI: 10.3969/j.issn.1006-6179.2024.03.005
摘要： 目的 筛选出均匀分布在大鼠染色体上的单核苷酸多态性( SNP) 位点,建立常用近交系大鼠遗传质量检测及品系鉴别方法。 方法 在文献中获得 SNP 共 141 个,利用 Ensembl 数据库中获取的信息筛选出在 BN、F344、GK、LEW、SHR 和 WKY 6 种大鼠品系中呈现多态性的 SNP 位点,并从中优化出均匀分布各染色体且包含品系特异性SNP 的最佳位点组合。 通过 PCR 扩增技术和 Sanger 测序方法对组合位点用于常用近交系大鼠遗传质量检测和品系鉴别的效果进行验证。 结果 优化出了在各品系内表现单态性、品系间呈多态性的 40 个 SNP 标记。 其中包含可以用于品系鉴别的特异性位点:4 个 BN 大鼠特异性位点,3 个 F344 大鼠特异性位点,2 个 GK 大鼠特异性位点,2个 LEW 大鼠特异性位点和 1 个 SHR 大鼠特异性位点。 分别利用 BN、F344、LEW、SHR 和 WKY 大鼠的 DNA 混合样本对优化出的 40 个位点进行验证,结果与网站数据一致。 结论 成功建立了常用近交系大鼠遗传质量检测及品系鉴别的 SNP 组合。
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