摘要:目的 研究退役老龄C57BL/6小鼠的肠道菌群特征。方法 分别收集雌性8周龄(对照组,10只)和退役72 周龄(老年组,10只)C57BL/6小鼠的直肠内容物样品,采用16S rRNA通用引物扩增V3-V4区并进行高通量测序, 使用QIIME软件对不同组样品中菌群组成和多样性指标进行分析,使用线性判别分析效应大小(LEfSe)软件比较 各组样品中具有统计学差异的菌群标志物。结果 从20只C57BL/6小鼠的肠道菌群样本中共获得16S rRNA有 效序列1 618 804条。在门水平上,拟杆菌门和厚壁菌门在两组样品中都是相对丰度较高的优势菌。α多态性分析 结果显示,Observed features、Chao1、Shannon、Simpson、Good′s coverage等5项指标在两组样品中均无显著差异(P> 0.05);β多态性分析结果显示,老龄组小鼠与对照组小鼠肠道内容物样品差异有统计学意义(P<0.05);LEfSe分析 结果表明,在老龄组小鼠的肠道菌群中,红蝽菌纲(Coriobacteriia),红蝽菌目(Coriobacteriales),埃格特菌科 (Eggerthellaceae)和肠杆菌属(Enterorhabdus)的细菌被鉴定为具有显著性差异的生物标志物。Clostridia-UCG-014所 属的目,理研菌科(Rikenellaceae)和另枝菌属(Alistipes)的细菌则在对照组小鼠的肠道菌群内显著富集。结论 本研 究利用16S rRNA 高通量测序分析了退役老龄C57BL/6小鼠直肠内容物肠道菌群的组成、丰度等基本特点,为深入 了解退役老龄C57BL/6小鼠的生物学特性,以及开展衰老相关研究中动物模型的选用提供了基础数据。
关键词: 衰老;C57BL/6小鼠;肠道菌群;16S rRNA 高通量测序
